20世紀(jì)70年代，假面騎士1號和2號聯(lián)手打敗了邪惡組織修卡，但是神秘而邪惡的假面騎士3號突然出現(xiàn)，以壓倒性的實力擊敗了1號、2號，世界的歷史就此發(fā)生改變。21世紀(jì)，原本生活在和平自由年代下的民眾，突然委身于修卡團伙的統(tǒng)治之下。曾經(jīng)正義一方的泊進之介（竹內(nèi)涼真 飾）則淪為修卡特狀課的走狗。修卡喪盡天良，從小污染少年兒童純潔的心靈。假面騎士BLACK南光太郎（倉田てつを 飾）決不允許如此惡行發(fā)生，他孤身一人和修卡展開對抗，而進之介則與之展開連番對抗。戰(zhàn)斗之中，光太郎的義舉和修卡的丑惡行徑讓進之介的良心大受觸動。
而就在此時，假面騎士3號的變身者黑井響一郎（及川光博 飾）突然出現(xiàn)，他正是左右著歷史進程的關(guān)鍵人物……