鈴木財(cái)團(tuán)最新的高級酒店落成，小蘭（黑川智花 飾）、阿笠博士（田山?jīng)龀?飾）、柯南（藤崎直 飾；高山南 配音）、灰原哀（柴田幸花 飾；林原惠美 配音）受到園子（巖佐真悠子 飾）的邀請出席了隆重的開幕儀式。與此同時(shí)，“日本小姐”評選大賽慶功宴也在酒店同期召開，可就在此前不久，針對日本小姐獲獎?wù)邏劭蓱z（奈都紀(jì) 飾）的威脅書送到了負(fù)責(zé)人的手中。當(dāng)所有人都高度緊張的時(shí)刻，可憐突然失蹤，當(dāng)她再次出現(xiàn)在眾人面前時(shí)，卻已被殺害，以提線木偶般的恐怖形象登場。
詭異的是，柯南和哀在吃了某個(gè)蛋糕后神奇地恢復(fù)成工藤新一（小栗旬 飾）和宮野志保（香椎由宇 飾）的本尊形象。他們一面要追查殺害可憐的真正兇手，一面要準(zhǔn)備與躲在暗處的黑暗組織展開對決……