故事發(fā)生在夏亞引領(lǐng)吉翁公國(guó)軍贏得一年戰(zhàn)爭(zhēng)的平行宇宙。這一歷史轉(zhuǎn)折點(diǎn)導(dǎo)致地球聯(lián)邦與吉翁公國(guó)的勢(shì)力格局劇變。在空中宇宙殖民衛(wèi)星生活的女高中生天手讓葉，與難民少女尼婭安相遇后被卷入非法MS決斗競(jìng)技“軍團(tuán)戰(zhàn)”，她駕駛著神秘最新型MS“GQuuuuuuX（吉夸克斯）”投身其中，而被通緝的神秘MS“高達(dá)”駕駛員修司伊藤也出現(xiàn)在她們面前。自此，少女與少年的相遇，夢(mèng)想就此交織，宇宙世紀(jì)開啟了新的未來(lái)......